MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 plasmid RPME01

Total Repeats: 12938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008826	CAT	3	9	13	21	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262547
2	NC_008826	CTG	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262547
3	NC_008826	CGGC	2	8	66	73	0 %	0 %	50 %	50 %	124262547
4	NC_008826	AGG	2	6	78	83	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262547
5	NC_008826	GCT	2	6	94	99	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262547
6	NC_008826	GCG	2	6	114	119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262547
7	NC_008826	CGC	2	6	169	174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262547
8	NC_008826	GCCTGC	2	12	266	277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124262547
9	NC_008826	CCT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262547
10	NC_008826	CGA	2	6	310	315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262547
11	NC_008826	GCC	2	6	333	338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262547
12	NC_008826	GCT	3	9	361	369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262547
13	NC_008826	AGC	2	6	372	377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262547
14	NC_008826	CGCCT	2	10	395	404	0 %	20 %	20 %	60 %	124262547
15	NC_008826	CGA	2	6	505	510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262547
16	NC_008826	TCG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262547
17	NC_008826	CTC	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262547
18	NC_008826	GAG	2	6	786	791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262547
19	NC_008826	GC	3	6	802	807	0 %	0 %	50 %	50 %	124262547
20	NC_008826	TGG	2	6	843	848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262547
21	NC_008826	ACG	2	6	849	854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262547
22	NC_008826	GAG	2	6	899	904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262547
23	NC_008826	CGAC	2	8	905	912	25 %	0 %	25 %	50 %	124262547
24	NC_008826	GCG	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262547
25	NC_008826	AGA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124262547
26	NC_008826	GCC	2	6	1022	1027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262547
27	NC_008826	GCG	2	6	1118	1123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262547
28	NC_008826	GCCG	2	8	1201	1208	0 %	0 %	50 %	50 %	124262547
29	NC_008826	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262547
30	NC_008826	GCCG	2	8	1338	1345	0 %	0 %	50 %	50 %	124262547
31	NC_008826	AAC	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262548
32	NC_008826	TCG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262548
33	NC_008826	CAT	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262548
34	NC_008826	GGT	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262548
35	NC_008826	CGA	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262548
36	NC_008826	GCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262548
37	NC_008826	CTGCCG	2	12	1752	1763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124262548
38	NC_008826	AGG	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262548
39	NC_008826	CAG	2	6	1812	1817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262548
40	NC_008826	GCT	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262548
41	NC_008826	CTGCT	2	10	1983	1992	0 %	40 %	20 %	40 %	124262548
42	NC_008826	CTT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124262548
43	NC_008826	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262548
44	NC_008826	GCA	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262548
45	NC_008826	ACCC	2	8	2129	2136	25 %	0 %	0 %	75 %	124262548
46	NC_008826	CTC	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262548
47	NC_008826	CTC	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262548
48	NC_008826	TGC	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262548
49	NC_008826	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262548
50	NC_008826	CGCT	2	8	2317	2324	0 %	25 %	25 %	50 %	124262548
51	NC_008826	TCG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262548
52	NC_008826	GCC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262548
53	NC_008826	TCG	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262548
54	NC_008826	GC	3	6	2467	2472	0 %	0 %	50 %	50 %	124262548
55	NC_008826	TCC	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262548
56	NC_008826	CAC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124262548
57	NC_008826	TGT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124262548
58	NC_008826	GCG	2	6	2630	2635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262548
59	NC_008826	CTT	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124262548
60	NC_008826	GCG	2	6	2799	2804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262548
61	NC_008826	CCA	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124262548
62	NC_008826	GCTG	2	8	2813	2820	0 %	25 %	50 %	25 %	124262548
63	NC_008826	TCA	2	6	2886	2891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262548
64	NC_008826	CGGCGC	2	12	2960	2971	0 %	0 %	50 %	50 %	124262548
65	NC_008826	GC	4	8	2968	2975	0 %	0 %	50 %	50 %	124262548
66	NC_008826	TGA	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124262549
67	NC_008826	TCG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262549
68	NC_008826	GC	3	6	3228	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	124262549
69	NC_008826	GGGAC	2	10	3245	3254	20 %	0 %	60 %	20 %	124262549
70	NC_008826	TGC	2	6	3328	3333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262549
71	NC_008826	CTG	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262549
72	NC_008826	ACT	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262549
73	NC_008826	GCTC	2	8	3396	3403	0 %	25 %	25 %	50 %	124262549
74	NC_008826	GCG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262549
75	NC_008826	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262549
76	NC_008826	GGCAAG	2	12	3484	3495	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	124262549
77	NC_008826	AGC	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262549
78	NC_008826	ACC	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124262549
79	NC_008826	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262549
80	NC_008826	TCGAG	2	10	3768	3777	20 %	20 %	40 %	20 %	124262549
81	NC_008826	GTCG	2	8	3895	3902	0 %	25 %	50 %	25 %	124262549
82	NC_008826	GTGGCA	2	12	3912	3923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124262549
83	NC_008826	ACCTTG	2	12	3938	3949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124262549
84	NC_008826	TTG	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124262550
85	NC_008826	CGG	2	6	4063	4068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262550
86	NC_008826	GCCT	2	8	4108	4115	0 %	25 %	25 %	50 %	124262550
87	NC_008826	TGG	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262550
88	NC_008826	TCGG	2	8	4174	4181	0 %	25 %	50 %	25 %	124262550
89	NC_008826	CAG	2	6	4192	4197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262550
90	NC_008826	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262550
91	NC_008826	TCG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262550
92	NC_008826	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262550
93	NC_008826	CGTC	2	8	4340	4347	0 %	25 %	25 %	50 %	124262550
94	NC_008826	GC	3	6	4357	4362	0 %	0 %	50 %	50 %	124262550
95	NC_008826	ATC	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262550
96	NC_008826	GCC	2	6	4417	4422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262550
97	NC_008826	CAGC	2	8	4428	4435	25 %	0 %	25 %	50 %	124262550
98	NC_008826	TCG	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262550
99	NC_008826	TGCT	2	8	4537	4544	0 %	50 %	25 %	25 %	124262550
100	NC_008826	GGT	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262550
101	NC_008826	GAC	2	6	4554	4559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262550
102	NC_008826	GCG	2	6	4566	4571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262550
103	NC_008826	TGC	3	9	4591	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262550
104	NC_008826	GCAC	2	8	4702	4709	25 %	0 %	25 %	50 %	124262550
105	NC_008826	TCG	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262550
106	NC_008826	CGGC	2	8	4749	4756	0 %	0 %	50 %	50 %	124262550
107	NC_008826	GGC	2	6	4775	4780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262550
108	NC_008826	CGC	3	9	4901	4909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262551
109	NC_008826	T	7	7	4910	4916	0 %	100 %	0 %	0 %	124262551
110	NC_008826	CG	3	6	4939	4944	0 %	0 %	50 %	50 %	124262551
111	NC_008826	CCGG	2	8	4990	4997	0 %	0 %	50 %	50 %	124262551
112	NC_008826	CCA	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124262551
113	NC_008826	CTTG	2	8	5158	5165	0 %	50 %	25 %	25 %	124262551
114	NC_008826	TCAT	2	8	5166	5173	25 %	50 %	0 %	25 %	124262551
115	NC_008826	TGC	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262552
116	NC_008826	GCC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262552
117	NC_008826	CGGA	2	8	5634	5641	25 %	0 %	50 %	25 %	124262552
118	NC_008826	TCA	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262552
119	NC_008826	CGG	2	6	5680	5685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262552
120	NC_008826	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262553
121	NC_008826	CTC	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262553
122	NC_008826	GATC	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	124262553
123	NC_008826	CAA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262553
124	NC_008826	TGCA	2	8	6078	6085	25 %	25 %	25 %	25 %	124262553
125	NC_008826	ACGA	2	8	6170	6177	50 %	0 %	25 %	25 %	124262554
126	NC_008826	CCAAG	2	10	6285	6294	40 %	0 %	20 %	40 %	124262554
127	NC_008826	AGC	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262554
128	NC_008826	CTG	2	6	6562	6567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262554
129	NC_008826	CGC	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262554
130	NC_008826	TGC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262554
131	NC_008826	GGC	2	6	6639	6644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262554
132	NC_008826	CAA	3	9	6663	6671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262554
133	NC_008826	TCGTG	2	10	6683	6692	0 %	40 %	40 %	20 %	124262554
134	NC_008826	GA	3	6	6954	6959	50 %	0 %	50 %	0 %	124262555
135	NC_008826	CGC	2	6	7009	7014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262555
136	NC_008826	TGG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262555
137	NC_008826	TGCGG	2	10	7078	7087	0 %	20 %	60 %	20 %	124262555
138	NC_008826	AAGC	2	8	7099	7106	50 %	0 %	25 %	25 %	124262555
139	NC_008826	TGG	2	6	7121	7126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262555
140	NC_008826	GCA	2	6	7176	7181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262555
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142	NC_008826	GTC	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262555
143	NC_008826	CT	3	6	7530	7535	0 %	50 %	0 %	50 %	124262556
144	NC_008826	CCG	3	9	7539	7547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262556
145	NC_008826	GCT	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262556
146	NC_008826	GACGG	2	10	7610	7619	20 %	0 %	60 %	20 %	124262556
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148	NC_008826	CTG	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262556
149	NC_008826	GCA	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262556
150	NC_008826	CGC	2	6	7856	7861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262557
151	NC_008826	GCCG	2	8	7905	7912	0 %	0 %	50 %	50 %	124262557
152	NC_008826	CCT	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262557
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157	NC_008826	GCT	3	9	8316	8324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262557
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159	NC_008826	GCCC	2	8	8347	8354	0 %	0 %	25 %	75 %	124262557
160	NC_008826	ACG	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262557
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162	NC_008826	CGG	3	9	8450	8458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262557
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164	NC_008826	GCG	2	6	8564	8569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262557
165	NC_008826	TCG	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262557
166	NC_008826	TGCT	2	8	8609	8616	0 %	50 %	25 %	25 %	124262557
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170	NC_008826	TCA	2	6	8747	8752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262557
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173	NC_008826	CTT	2	6	8844	8849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124262557
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245	NC_008826	ACGGCG	2	12	12440	12451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124262561
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248	NC_008826	CAG	2	6	12660	12665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262561
249	NC_008826	GGCGA	2	10	12670	12679	20 %	0 %	60 %	20 %	124262561
250	NC_008826	GACGC	2	10	12814	12823	20 %	0 %	40 %	40 %	124262561
251	NC_008826	CTC	2	6	12835	12840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124262561
252	NC_008826	ACG	2	6	12845	12850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262561
253	NC_008826	A	7	7	13397	13403	100 %	0 %	0 %	0 %	124262562
254	NC_008826	CTG	2	6	13405	13410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
255	NC_008826	TGGCCG	2	12	13439	13450	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124262562
256	NC_008826	CCTT	2	8	13479	13486	0 %	50 %	0 %	50 %	124262562
257	NC_008826	CGA	2	6	13536	13541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
258	NC_008826	GCG	2	6	13559	13564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262562
259	NC_008826	AAC	2	6	13576	13581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262562
260	NC_008826	CGC	2	6	13671	13676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
261	NC_008826	GCA	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
262	NC_008826	ACT	2	6	13718	13723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262562
263	NC_008826	CGC	2	6	13725	13730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
264	NC_008826	GCC	2	6	13744	13749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
265	NC_008826	GCC	2	6	13756	13761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
266	NC_008826	CGATG	2	10	13797	13806	20 %	20 %	40 %	20 %	124262562
267	NC_008826	AACG	2	8	13861	13868	50 %	0 %	25 %	25 %	124262562
268	NC_008826	CAGGA	2	10	13889	13898	40 %	0 %	40 %	20 %	124262562
269	NC_008826	CA	3	6	13911	13916	50 %	0 %	0 %	50 %	124262562
270	NC_008826	CGG	2	6	13938	13943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262562
271	NC_008826	ACT	2	6	13964	13969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262562
272	NC_008826	AAC	2	6	13978	13983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262562
273	NC_008826	GCAG	2	8	14003	14010	25 %	0 %	50 %	25 %	124262562
274	NC_008826	GCT	2	6	14040	14045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
275	NC_008826	CG	3	6	14054	14059	0 %	0 %	50 %	50 %	124262562
276	NC_008826	CCG	2	6	14060	14065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
277	NC_008826	GCT	2	6	14298	14303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
278	NC_008826	CAG	2	6	14355	14360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
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280	NC_008826	TCG	2	6	14510	14515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
281	NC_008826	CG	3	6	14514	14519	0 %	0 %	50 %	50 %	124262562
282	NC_008826	CAAG	2	8	14538	14545	50 %	0 %	25 %	25 %	124262562
283	NC_008826	GAC	2	6	14559	14564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
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285	NC_008826	CCA	2	6	14621	14626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124262562
286	NC_008826	AGGCCA	2	12	14627	14638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
287	NC_008826	CAA	2	6	14661	14666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124262562
288	NC_008826	CGC	2	6	14819	14824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
289	NC_008826	TAC	2	6	14839	14844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262562
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291	NC_008826	TGC	2	6	14882	14887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
292	NC_008826	GCC	2	6	14889	14894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124262562
293	NC_008826	ACG	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
294	NC_008826	GAC	2	6	14914	14919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262562
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297	NC_008826	TGG	2	6	15022	15027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124262562
298	NC_008826	GC	3	6	15057	15062	0 %	0 %	50 %	50 %	124262562
299	NC_008826	TCG	2	6	15098	15103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262562
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373	NC_008826	CTTCC	2	10	19526	19535	0 %	40 %	0 %	60 %	124262566
374	NC_008826	TGC	2	6	19567	19572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124262566
375	NC_008826	CGA	2	6	19627	19632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262566
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382	NC_008826	GGC	2	6	20026	20031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262566
383	NC_008826	AGC	2	6	20118	20123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124262566
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385	NC_008826	CGGT	2	8	20180	20187	0 %	25 %	50 %	25 %	124262566
386	NC_008826	GC	3	6	20222	20227	0 %	0 %	50 %	50 %	124262566
387	NC_008826	GC	3	6	20230	20235	0 %	0 %	50 %	50 %	124262566
388	NC_008826	GGA	2	6	20305	20310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262566
389	NC_008826	GCG	2	6	20312	20317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124262566
390	NC_008826	GAG	3	9	20320	20328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124262566
391	NC_008826	CAT	2	6	20471	20476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124262567
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